從學(xué)習(xí)中醫(yī)的角度看，元?dú)庹撟鳛檎軐W(xué)背景，其凸顯在知識(shí)層面的內(nèi)容雖然沒有陰陽、五行學(xué)說明顯，但作為中國文化的最深層底蘊(yùn)，若對之理解未透，不但大大影響對中醫(yī)體系內(nèi)容的深度把握，更易在中醫(yī)學(xué)發(fā)展的路上迷失。
       從學(xué)習(xí)中醫(yī)的角度看，元?dú)庹撟鳛檎軐W(xué)背景，其凸顯在知識(shí)層面的內(nèi)容雖然沒有陰陽、五行學(xué)說明顯，但作為中國文化的最深層底蘊(yùn)，若對之理解未透，不但大大影響對中醫(yī)體系內(nèi)容的深度把握，更易在中醫(yī)學(xué)發(fā)展的路上迷失。
       　兩論的比較
       純粹就“氣”論“氣”，以現(xiàn)代人不太深厚的國學(xué)功底，確實(shí)難以理解得透徹，幸好關(guān)于世界的本原，古代西方也有一個(gè)與“元?dú)庹摗苯咏鼘Φ鹊膶W(xué)說，就是公元前4~5世紀(jì)間，留基伯和他的學(xué)生德謨克利特主張的“原子論”。這里，“元”與“原”同義，“氣”與“子”則可看作是對萬物基元單位的各自表述，這是在唯物本體論上兩論所見略同處，但更值得品味的是兩論深層之異。由于中醫(yī)學(xué)以元?dú)庹摓楦麽t(yī)學(xué)以原子論為基，比較元?dú)庹撆c原子論就是審視鑄就東西兩大文化體系差異的文化基因，因此這種剖析最容易把中西醫(yī)學(xué)體系的深層內(nèi)蘊(yùn)，諸如不同的價(jià)值取向、思維風(fēng)格、學(xué)術(shù)思想、研究方式乃至具體內(nèi)容以較清晰的方式呈現(xiàn)出來。（兩論的簡要比較見表右）
       為方便分析與敘述，下文將表中關(guān)聯(lián)性較大者以某項(xiàng)為中心作連帶討論，不逐項(xiàng)分割：
       1、宇宙本原之鑒
       中國的“道氣論”視“元?dú)狻睘橛钪姹驹！尔i冠子·泰錄》謂：“天地成于元?dú)猓f物成于天地。”西方則以“原子”為構(gòu)成宇宙萬物的基元物質(zhì)。著名哲學(xué)家張岱年先生將兩種本原之細(xì)微處表達(dá)得妙趣橫生：“西洋哲學(xué)中之原子論，謂一切氣皆微小固體而成；中國哲學(xué)中元?dú)庹摚瑒t謂一切固體是氣之凝結(jié)，亦可謂適成一種對照。”表面看來，兩論均肯定了世界本原的物質(zhì)性，所異僅因不同的文化背景與語言習(xí)慣分別歸結(jié)為“元?dú)狻焙汀霸印保m異曲卻似同功。但若細(xì)究，兩說又存深刻差異。
       2、存在形式之異
       元?dú)獾谋驹瓲顟B(tài)是無形而彌散狀態(tài)之氣，王夫之謂：“氣彌淪無涯而希微不形。”（《正蒙注·太和》）但氣聚則可成形，即有形實(shí)體是氣，無形虛處也是氣，有無之間可轉(zhuǎn)換交流。張載《正蒙·太和》概括得好：“太虛無形，氣之本體，其聚其散，變化之客形爾。” 由于陰陽學(xué)說的導(dǎo)入，陰陽特性之一是其無限可分性，因氣可分陰陽，據(jù)此邏輯，則氣也是無限可分。換言之，在中國的宇宙構(gòu)成觀中不一定存在最終物質(zhì)。事實(shí)上，現(xiàn)代科學(xué)直到現(xiàn)在也只能說發(fā)現(xiàn)一些基本粒子，尚不敢確定說這個(gè)世界存在著最終物質(zhì)。氣的無限可分性大大地增加了氣的變數(shù)以及說理上與時(shí)俱進(jìn)的優(yōu)點(diǎn)。就如不論現(xiàn)代科學(xué)最微觀的物質(zhì)單位發(fā)展到哪個(gè)層次，都可說未離氣的范疇，還預(yù)留了再進(jìn)一步細(xì)化的空間。
       原子論認(rèn)為世界的本原是原子和虛空。原子的存在形式是有形。“原子”，希臘文原義有“不可分割”之義，指的是最后的不可分的物質(zhì)微粒或單位。據(jù)此，世界萬物都是由微細(xì)而不可分，具形質(zhì)、重量的原子所構(gòu)成。由于每個(gè)原子都是毫無空隙的，因此，它的基本屬性是“充實(shí)性”。與之相對的虛空的性質(zhì)是空曠，是絕對的無，僅給原子活動(dòng)提供空間。原子與虛空之間不存在轉(zhuǎn)換與交流。
       3、作用形式之較
       由于元?dú)饪梢苑株庩枺虼耍渥饔眯问交騼?nèi)部動(dòng)力就是處在相互交感中的陰陽對立制約、互根互用、消長轉(zhuǎn)化、自和協(xié)調(diào)的內(nèi)部矛盾。
       運(yùn)動(dòng)是原子固有的屬性，虛空為原子的運(yùn)動(dòng)提供了場所。形狀、體積和序列不同的原子互相結(jié)合，就產(chǎn)生了各種不同的復(fù)合物。原子分離，物體便煙滅。但原子為什么自己能運(yùn)動(dòng)，德謨克利特卻沒能作出解釋，因此，原子雖在觀念上具自動(dòng)之意，形式上卻又不得不傾向于在外部尋找動(dòng)力之源。
       4、自然觀之差
       由于氣本無形，氣細(xì)無內(nèi)，大無外，亦無間隙，故無所不通。《管子·心術(shù)上》說：“無形則無所抵牾，無所抵牾，故遍流萬物而不變。”有形無形之間可轉(zhuǎn)換交流，故乍看互不相干的萬物可通過“氣”的中介而成為互有聯(lián)系的整體。這樣，就構(gòu)成了一幅形在氣中、氣在形中、形氣交融的宇宙氣化全圖景，由此導(dǎo)出的就是萬事萬物一氣相牽的有機(jī)聯(lián)系自然觀。
       原子有形，既然萬物均是由分散存在的“原子”組合而成的，原子與虛空之間又不存在轉(zhuǎn)換與交流，因此萬物均可分解，可以把整體分解為部分，再據(jù)需要把部分一層層分解為更小的部分，直到原子本身。由此導(dǎo)出萬物可以或應(yīng)該分割來看的機(jī)械自然觀。
       5、整體觀之別
       由于中醫(yī)學(xué)強(qiáng)調(diào)整體觀念。因此，不少人以為整體觀是中醫(yī)特有并區(qū)別于其他醫(yī)學(xué)的主要特征。
       “元?dú)庹摗钡恼w是一個(gè)“元整體”，即認(rèn)為以元?dú)鉃榛挠钪媸且粋€(gè)混元整體，萬物均由元?dú)夥只鴣恚椿煸w分化出其內(nèi)部不可分割、相互聯(lián)系的各個(gè)部分。就如宇宙逐級分化出星系→星球→地球→萬物→生物→人→系統(tǒng)→臟腑組織→精血津液→氣。其形式可為氣化氣、氣化形、形化氣、形化形，一切事物都處在氣化流衍之中。在這里，整體是原生的，部分則派生于整體，故而整體決定著其內(nèi)部的各部分，形成一個(gè)真正融會(huì)貫通的宇宙整體。
       更基于氣的運(yùn)動(dòng)性，元整體是一直處在不斷的變動(dòng)過程中。在這個(gè)整體中，任何一個(gè)局部有形、無形的微細(xì)變化，都可因一氣相牽而會(huì)引起整體的相關(guān)反應(yīng)，這個(gè)整體的本質(zhì)或基礎(chǔ)就是氣的變化流衍，因此，元整體具有不可分割性。整體若作分解，失去聯(lián)系的各部分均不具完整性。只有在天然的，不可分割的狀態(tài)下才可準(zhǔn)確把握事物的完整本質(zhì)，避免以偏概全的一孔之見。
       “原子論”的整體是一個(gè)“合整體”。原子是構(gòu)成宇宙的最終物質(zhì)，萬物均由原子組成，原子→物質(zhì)→小局部→大局部→整體就是其組合過程。因此，整體是由從小到大的各個(gè)部分綜合而成。部分是原生的，整體派生于部分，雖然部分可受整體背景影響，但作為邊界清晰的部分亦可離開整體而單獨(dú)存在。在方法學(xué)上就是部分可以分割研究。既然部分綜合成了整體，因此部分決定整體就言之成理了。
       中醫(yī)研究方式之思
       元?dú)庹撆c原子論之辨實(shí)可引發(fā)對現(xiàn)代中醫(yī)科研方法的反思。
       1、研究對象與研究方式之適
       由于氣本無形，又無限可分，是以研究氣之“形態(tài)”在邏輯上來說應(yīng)是徒勞無功的，故“元?dú)庹摗比菀讓?dǎo)向?qū)π螒B(tài)研究和解剖分析的淡漠。又因氣以不斷運(yùn)動(dòng)，有形與無形又可交流潛通而具可入性，形與形、形與氣、氣與氣間沒有任何隔閡，整體以難以分割的不間斷狀態(tài)存在，萬事萬物由不同的氣聚散而成，更可因氣而建立聯(lián)系，一切事物都處在氣的流衍及氣化氤氳之中，形成一個(gè)真正融會(huì)貫通的宇宙元整體。因此，其注重的重心是關(guān)系實(shí)在而非物質(zhì)實(shí)體，觀察視野偏于宏觀，研究方法更關(guān)注聯(lián)系性及協(xié)調(diào)性，任何一個(gè)局部都是整體中的局部，牽一發(fā)而動(dòng)全身，故往往將部分聯(lián)系成整體或置于整體中觀察。中醫(yī)理論體系由是有了整體、動(dòng)態(tài)、聯(lián)系、協(xié)調(diào)等特征。而任何破壞或妨礙這些特征的研究方法均難窺其全貌應(yīng)屬常識(shí)。
       由于萬物均由有形的“原子”組合而成，“原子”是最終物質(zhì)，部分決定整體。且原子與虛空不存交流，萬物均可分解，理論上只要技術(shù)跟得上，若將研究對象一層一層地降解，應(yīng)可還原到“原子”水平，最終物質(zhì)的找到就意味著事物或現(xiàn)象的終極原因?qū)?huì)呈現(xiàn)。將此基本信念貫徹到科研中，就是把整體分拆為部分來觀察，以部分來解釋或組合整體，其注重的重心是物質(zhì)實(shí)體而非關(guān)系實(shí)在，研究方法更關(guān)注于縱向深入，微觀分析。在這種不斷降解、深化的探微尋源過程中各自然學(xué)科得以延伸進(jìn)步。這種方法在面對“形態(tài)科學(xué)”這種合適對象的研究上自有其優(yōu)勢，如對整體中的部分有著比“元?dú)庹摗狈椒ǜ钊搿⒓?xì)致、微觀的認(rèn)識(shí)，形成較精確、嚴(yán)謹(jǐn)?shù)脑恚⑿问竭壿嫺鼑?yán)密的概念體系。不難看出，還原論思維或還原分析方法的哲學(xué)基礎(chǔ)就是原子論。在此觀念下，西醫(yī)學(xué)采用解剖方法，將人逐層分解以還原、分析，自是研究的必然途徑。
       2、“研究中醫(yī)”與“中醫(yī)研究”
       本來“兩論”下的對象各有其自身適合的研究方式，但現(xiàn)今流行的大多所謂新法，多半是建立在“原子論”奠基的“形態(tài)科學(xué)”上的還原分析方法。以之研究中醫(yī)，不能說全無借鑒處，但面對以“元?dú)庹摗睘榛闹嗅t(yī)學(xué)術(shù)，其隔閡本應(yīng)可想而知。但不少研究者對此所取的態(tài)度往往是視而不見。或天真地以為，只要儀器夠尖端，指標(biāo)夠先進(jìn)，一切問題都將迎刃而解。但是，作為支配研究方式、研究儀器、研究指標(biāo)的方法論真的可以擱置不論嗎？
       國醫(yī)大師陸廣莘在訪談中提出過“中醫(yī)研究”和“研究中醫(yī)”是兩種不同的概念。目前時(shí)行的中醫(yī)相關(guān)研究，由于心態(tài)上唯恐“不科學(xué)”，因此，無論在方法學(xué)、還是應(yīng)用儀器或檢測指標(biāo)上多是拼命地追新，以為越新就越科學(xué)。若以陸老的分類觀點(diǎn)為判，此大抵為“研究中醫(yī)”，而非“中醫(yī)研究”。
       這種與“元?dú)庹摗鼻〕杀车蓝Y的研究方法之局限性也顯而易見。把復(fù)雜的事物通過還原、降解使之簡單化是此法的基本方式，但面對不應(yīng)分解、不可還原的對象和內(nèi)容，譬如“元整體”背景下的中醫(yī)學(xué)時(shí)，勉強(qiáng)分解實(shí)是對整體聯(lián)系的破壞。復(fù)雜現(xiàn)象的復(fù)雜性機(jī)制是無法簡而化之的。須知，“整體大于部分之和”無論在哲學(xué)上，還是在自然科學(xué)上都是一個(gè)常理。整體不是由其中多個(gè)部分簡單堆砌而成，而是各部分有效組合的一個(gè)整體，所以有機(jī)協(xié)調(diào)的系統(tǒng)整體大于部分的總和，無論這個(gè)整體是合整體還是元整體。即便是研究合整體背景下的西醫(yī)學(xué)，還原分析方法其實(shí)也時(shí)顯力不從心，局部分解得越精細(xì)，越微觀，其在整體中的關(guān)系就越復(fù)雜，而處理復(fù)雜關(guān)系并非此法之所長。
       中醫(yī)學(xué)天人間、人體內(nèi)層層錯(cuò)綜復(fù)雜的關(guān)系網(wǎng)特性比“形態(tài)科學(xué)”之西醫(yī)復(fù)雜。中國科學(xué)院朱清時(shí)院士對這個(gè)問題看得透徹：“以中醫(yī)為代表的傳統(tǒng)科學(xué)總是把復(fù)雜事物看作整體來研究，他們認(rèn)為，若把事件簡化成最基本的單元，就要把許多重要信息都去除掉，如單元之間的連接與組合方式等等，這樣做就把復(fù)雜事物變樣了。”因此，以還原分析方法來肢解“元整體”的對象，企求在還原出對象的真象同時(shí)而又不使信息丟失的想法不知算不算一種天真？天真，做人或者可以，但從事科學(xué)研究，恰恰是最不需要的品格。
       某日看鏘鏘三人行節(jié)目，嘉賓為陳丹青先生與查建英女士，話題涉及西裝本非按東方人的身材來設(shè)計(jì)，但由于集體心理暗示，當(dāng)大家都穿西裝時(shí)，穿西裝就成了美，這是一種從眾心理，是自主審美系統(tǒng)喪失的表現(xiàn)。即現(xiàn)在的國人已失去自信，失去以自己的眼睛看自己的能力。這就引出一問：由于還原論方法在近現(xiàn)代科學(xué)中不斷取得成績時(shí)，人們下意識(shí)地將之當(dāng)作唯一的科學(xué)標(biāo)準(zhǔn)或潛在的標(biāo)準(zhǔn)是否也是一種從眾心理或集體心理暗示？是否同樣也屬失去以自己的眼睛看自己的能力？
       學(xué)術(shù)界在引進(jìn)西方科學(xué)的同時(shí)，首先淡忘了科學(xué)還包括人文社會(huì)科學(xué)。中醫(yī)具有人文社會(huì)科學(xué)與自然科學(xué)的雙重特性是人所共知的事實(shí)。其次即便是自然科學(xué)本身也至少包括還原科學(xué)和系統(tǒng)科學(xué)。業(yè)界已開始正視諸如系統(tǒng)論、信息論、控制論、耗散結(jié)構(gòu)論、突變論、泛系方法論、運(yùn)籌學(xué)、協(xié)同學(xué)、模糊數(shù)學(xué)、混沌理論、紊亂學(xué)、模糊邏輯學(xué)等系統(tǒng)科學(xué)在處理復(fù)雜系統(tǒng)時(shí)的優(yōu)勢，其發(fā)展的新階段——復(fù)雜性科學(xué)正在興起，以彌補(bǔ)還原科學(xué)在處理復(fù)雜系統(tǒng)時(shí)的不足，而醫(yī)學(xué)研究的人體正是典型的復(fù)雜系統(tǒng)。既然還原論思維不可能完全認(rèn)識(shí)復(fù)雜世界的所有層面，因此，以之作為判斷每一學(xué)科或思維方式是否科學(xué)的標(biāo)準(zhǔn)，其不合理性不就顯而易見嗎？
       回看中醫(yī)，若從還原論的角度看，中醫(yī)的確存在不少“問題”，但若從“元?dú)庹摗被驈?fù)雜性科學(xué)的視野看，這些所謂的“問題”實(shí)際不一定是問題，大多僅是因視野、視角、文化表述或認(rèn)知習(xí)慣的不同而被誤解。如果結(jié)合西方科學(xué)劃界標(biāo)準(zhǔn)從清晰走向模糊、從一元走向多元的傾向，而以歷史的、多元格局的眼光看中醫(yī)，則以“元整體”為背景的，道器合一的中醫(yī)自然是現(xiàn)代主流科學(xué)之外的另一種科學(xué)形態(tài)，一門以古貫今的復(fù)雜性科學(xué)。
       朱清時(shí)院士對復(fù)雜性科學(xué)是如此認(rèn)識(shí)的：“近一二十年人們理解到原來復(fù)雜性科學(xué)不能用還原論的方法，還得用中醫(yī)這種宏觀、整體的思維方法，還得經(jīng)過反復(fù)實(shí)踐、形成經(jīng)驗(yàn)、經(jīng)過直覺或頓悟上升到概念或理論，這些概念或理論再到實(shí)踐中去驗(yàn)證或修改，然后實(shí)踐證明他的正確性。這種思維方式是人類社會(huì)的一種基本思維方式，特別是對復(fù)雜性事物。”
       《景景室醫(yī)稿雜存》謂：“我中華用氣化以醫(yī)病，其道本法乎天氣、地氣之變遷，病氣、藥氣之制伏。是藥之所以能治病者，其原理本乎四時(shí)陰陽而來，乃貫徹天人一致之學(xué)。若離乎陰陽之氣化，而言治病，視人如器物然，縱解剖極細(xì)，何能攸往咸宜哉？”本已掌握了道理還以為自己沒理，似未明在中醫(yī)學(xué)科，“氣”之理才是真正可循、可道、可法、可驗(yàn)之根本理。它理、它術(shù)、它技或可參考、借鑒、輔助，但不應(yīng)反客為主，更不能自失魂魄。
       中醫(yī)的長遠(yuǎn)發(fā)展，自然離不開與現(xiàn)代或未來科學(xué)的結(jié)合，但正確的方法與切入點(diǎn)很重要，在未找到適合研究人體復(fù)雜性的現(xiàn)代方法前，則研究方式或方法的選擇，首要的不是“新”，而是合適。中醫(yī)學(xué)有著自身的特點(diǎn)與發(fā)展內(nèi)在動(dòng)力，至少在目前，自主的、內(nèi)源性的“中醫(yī)研究”應(yīng)成為中醫(yī)繼承與發(fā)展的主流。