《內(nèi)經(jīng)》不僅有關(guān)于臟腑與時辰相配屬的認(rèn)識，而且還根據(jù)經(jīng)脈自身的特點(diǎn)，提出了經(jīng)脈與時辰的配屬關(guān)系。
       《內(nèi)經(jīng)》不僅有關(guān)于臟腑與時辰相配屬的認(rèn)識，而且還根據(jù)經(jīng)脈自身的特點(diǎn)，提出了經(jīng)脈與時辰的配屬關(guān)系。古人在天有十二月、地有十二水、日有十二時（辰）、人有十二經(jīng)的“天人相應(yīng)”思想指導(dǎo)下，逐漸發(fā)現(xiàn)了十二經(jīng)脈流注的先后順序及其與十二時辰的配屬關(guān)系。
       《靈樞》的《經(jīng)脈》和《營氣》等篇記載了十二經(jīng)脈流注交接次序。如《營氣》篇關(guān)于營血流注過程的記載，說明十二經(jīng)脈交接的先后順序是從肺經(jīng)開始，而大腸經(jīng)，而胃經(jīng)，而脾經(jīng)，而心經(jīng)，而小腸經(jīng)，而膀胱經(jīng)，而腎經(jīng)，而心包經(jīng)，而三焦經(jīng)，而膽經(jīng)，而肝經(jīng)，復(fù)從肝經(jīng)注入肺經(jīng)，周而復(fù)始，循環(huán)無端，日夜運(yùn)行五十周。經(jīng)脈之所以有自手太陰至手陽明……至足厥陰，復(fù)至手太陰有序交接，是由十二經(jīng)脈之間陰陽表里及相互聯(lián)絡(luò)的特定結(jié)構(gòu)所決定的。至于營血的流注為何從手太陰經(jīng)開始，而肺為十二經(jīng)之首呢？其原因主要有二：首先，由于陰陽互根，營行脈中屬陰，衛(wèi)行脈外為陽，陽氣需賴陰精的主持與滋養(yǎng)，所以衛(wèi)氣雖日行于陽，夜行于陰各二十五周，但腎主藏陰精，故每周必交會于足少陰腎經(jīng)一次，即《靈樞·邪客》所謂“常從足少陰之分”；而營血屬陰，陰血必賴氣之統(tǒng)帥和推動，肺主氣，故其運(yùn)行每周必從手太陰肺經(jīng)開始。其次，營血的生化，雖然始于中焦，但水谷精微之氣須“上注于肺脈，乃化而為血”（《靈樞·營衛(wèi)生會篇》），所以營血的運(yùn)行亦必從肺始。
       在認(rèn)識到十二經(jīng)脈流注交接次序后，醫(yī)學(xué)家在實(shí)踐中，尤其是針灸實(shí)踐中，進(jìn)一步觀察到某經(jīng)疾病，在特定的時辰里施用治療，較其他時辰療效顯著，進(jìn)而發(fā)現(xiàn)了時辰與經(jīng)脈的關(guān)系。即以寅時配屬肺經(jīng)，《靈樞·陰陽系日月》云：“寅者，正月之生陽也。”《史記·律書》亦云：“寅言萬物始生”。在十二月中，寅屬正月，為生陽之氣，同樣一晝夜中寅主生陽，為十二時辰之首。由于手太陰為十二經(jīng)之首，而“寅”是一天之中陽氣初生之時，故寅配屬手太陰經(jīng)，可見，“寅”時與手太陰配屬是這一理論的關(guān)鍵。寅時配屬肺經(jīng)確定后，其余各經(jīng)便自然成有序排列。其配屬次序正是《靈樞·營氣》等篇記載的營氣在十二經(jīng)中流注的次序，即卯時配屬大腸經(jīng)、辰時配屬胃經(jīng)，巳時配屬脾經(jīng)、午時配屬心經(jīng)、未時配屬小腸經(jīng)、申時配屬膀胱經(jīng)、酉時配屬腎經(jīng)、戌時配屬心包經(jīng)、亥時配屬三焦經(jīng)、子時配屬膽經(jīng)、丑時配屬肝經(jīng)。與五臟是指五個功能活動系統(tǒng)一樣，這里的十二經(jīng)，也是指包括了經(jīng)別、經(jīng)筋、絡(luò)脈和皮部等在內(nèi)的十二經(jīng)生理功能活動系統(tǒng)。
       根據(jù)經(jīng)脈與時辰的配屬關(guān)系，便可以指導(dǎo)臨床運(yùn)用。臨床上，此理論主要運(yùn)用于時間疾病。首先判斷病證是在那個時辰加重、出現(xiàn)、減輕或消失，其病位即與該時辰相對應(yīng)的經(jīng)脈或其所屬的臟腑有關(guān)，然后根據(jù)脈證的具體情況，判定其證得虛實(shí)寒熱，作為進(jìn)一步治療的依據(jù)。如寅時為手太陰主時，病有寅時陣發(fā)咳喘者，可診為肺經(jīng)病，此時可取肺經(jīng)穴針灸治療，或用入肺經(jīng)之藥。不僅如此，由于該理論確定了經(jīng)脈與時辰的對應(yīng)配屬關(guān)系，所以也成為了后世子午流注針法的主要理論依據(jù)，為其形成與發(fā)展奠定了重要基礎(chǔ)。
       至于時辰與經(jīng)脈配屬的機(jī)理，古今醫(yī)家大多根據(jù)《經(jīng)脈》、《營氣》等篇關(guān)于營氣在十二經(jīng)流注的記載，認(rèn)為營氣、衛(wèi)氣或經(jīng)氣流注到某經(jīng)，使某經(jīng)氣血旺盛之時，便是其所配屬的時辰。實(shí)則，我們認(rèn)為，時辰與經(jīng)脈配屬的實(shí)質(zhì)，是每值某經(jīng)所配屬時，則該經(jīng)功能活動相對旺盛，自身敏感性增加。因而，能對針灸等治療效果產(chǎn)生影響。這一配屬和時辰與臟腑配屬同一道理，是人類在長期生存并適應(yīng)這個具有明顯節(jié)律變化的環(huán)境中所形成的。
       值得說明的是，在《內(nèi)經(jīng)》“天人相應(yīng)”和晝夜陰陽消長的理論指導(dǎo)下，張仲景在《傷寒論》提出六經(jīng)病各有“欲解時”之說，即“太陽病欲解時，從巳至未上。”“陽明病欲解時，從申至戌上。”“少陽病欲解時，從寅至辰上。”“太陰病欲解時，從亥至丑上。”“少陰病欲解時，從子至寅上。”“厥陰病欲解時，從丑至卯上。”說明“六經(jīng)”與時辰有特定的關(guān)系，但是由于各經(jīng)之病的欲解時，都涉及到三個時辰，因而對各“經(jīng)”與時辰的具體配屬，主要有三種解釋。其一，以每經(jīng)各配兩個時辰，六經(jīng)合為十二時辰，共一晝夜。即子丑配少陰、寅卯配厥陰、辰巳配少陽、午未配太陽、申酉配陽明、戌亥配太陰。由于此配屬明顯與經(jīng)文不符，所以未被醫(yī)學(xué)界廣泛接受。其次，以每經(jīng)各配屬三個時辰，這樣勢必導(dǎo)致其中四經(jīng)配時重復(fù)，另兩經(jīng)則無重復(fù)。因而缺乏統(tǒng)一性和規(guī)律性，亦未完善。再次找出各經(jīng)欲解的“中心時”，如“從巳至未上”，以午時為中心，則太陽病欲解時早不過巳，晚不過未。如此，卯配少陽、午配太陽、酉配陽明、子配太陰、丑配少陰、寅配厥陰。這種解釋與經(jīng)文記載相符，我們認(rèn)為尚可從。
       《傷寒論》“六經(jīng)”命名，即含各經(jīng)陰陽多少之意。在三陽中，太陽的陽氣最盛，少陽的陽氣最少，陽明介于兩者之間；三陰中，太陰的陰氣最盛，少陰的陰氣稍盛，而厥陰則是陰陽交換之經(jīng)，因而陰氣最少。晝?yōu)殛枺逝c“三陽經(jīng)”相配，“陽氣者，一日而主外，平旦人氣生，日中而陽氣隆，日西而陽氣已虛”，故卯時配屬人身之少陽；午時配屬人身之太陽；酉時陽氣雖虛，但仍盛于卯，故與陽明相配。夜為陰，故與“三陰經(jīng)”相配。夜半子時，自然界陰氣正盛，陽氣潛萌于下，故與人身之太陰相應(yīng)，丑時陽氣雖漸長，但陰氣尚盛，故與少陰相應(yīng)；寅時陽氣漸長，陰氣將盡而未盡，故與厥陰相應(yīng)。“六經(jīng)”與時辰相應(yīng)如此，因而各經(jīng)在其所配屬的時辰內(nèi)，功能相對旺盛，這也就是“欲解”的內(nèi)在依據(jù)，其與臟腑主時的道理是一致的。掌握“六經(jīng)”與時辰相應(yīng)的配屬，不僅對《傷寒論》所述疾病，而且對某些內(nèi)科雜病的病情預(yù)后、服藥時間的選擇，以及治療等，均有很大的臨床指導(dǎo)意義。
       以上介紹了十二經(jīng)脈時辰配屬和六經(jīng)時辰配屬，應(yīng)值得注意的是，臨床上，六經(jīng)時辰配屬主要適用于外感熱病及某些內(nèi)科雜病，而十二經(jīng)脈時辰配屬則主要運(yùn)用于經(jīng)脈病變。